【摘 要】
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目的：采用高通量焦磷酸测序技术分析持续性根尖周炎根尖段微生物群落组成的多样性,以了解持续性根尖周炎的主要致病菌群.材料与方法：根尖外科手术过程中,采集20例持续性根
【机 构】
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南京医科大学口腔疾病研究江苏省重点实验室
【出 处】
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中华口腔医学会牙体牙髓病学专业委员会第五次全国牙体牙髓病学临床学术研讨会
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目的：采用高通量焦磷酸测序技术分析持续性根尖周炎根尖段微生物群落组成的多样性,以了解持续性根尖周炎的主要致病菌群.材料与方法：根尖外科手术过程中,采集20例持续性根尖周炎患牙根尖段样本.样本经冷冻研磨后提取细菌总DNA.PCR扩增以构建宏基因组文库.经焦磷酸测序后进行种系发育分析、多样性分析和主成分分析.结果：共检出2206个OTUs,分属于20个菌门和216个菌属.在门水平,有7个门的丰度占到总序列的99％,为厚壁菌门(31％),变形菌门(23％),拟杆菌门(19％),梭杆菌门(12％),放线菌门(10％),互养菌门(2％),螺旋体门(2％).属水平上,有7个属的检出率为100％,同时丰度高于5％：普氏菌属,链球菌属,放线菌属,二氧化碳嗜纤维菌属,伯克氏菌属,梭菌属,纤毛菌属.其中,放线菌在各分类学水平上的丰度和检出率都较高,门水平为10％,属水平为4％,检出率均为100％.Good指数表明本次数据分析达到＞99％的覆盖率.稀疏曲线、多样性指数和丰富度指数表明本研究中检测到的OTUs和预计存在(真实存在的)OTUs之间存在少量间隙.主成分分析发现20例样本的微生物群落构成相似性不高.结论：持续性根尖周炎患牙根尖段微生物群落的多样性较高,说明根尖周炎的病因比我们想象的要复杂的多.放线菌和持续性根尖周炎有一定的相关性.
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