猪感染口蹄疫亚洲I型病毒VP1基因的克隆及其二级结构和B细胞抗原表位预测

来源 :中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第三届猪病防控学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wildboar2009
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对一株猪源口蹄疫亚洲I型毒株的主要抗原基因VP1进行了扩增和测序,并与国内外报道序列进行比时,发现与国内报道株同源性在83.3%-86.4%之间.采用Garnier-Robso法、Chou-Fasman法、Karplus-Schultz法时VP1序列进行二级结构分析,采用Kyte-Doolittle法分析氨基酸序列亲水性、Emini法预测特定区域位于蛋白质表面的可能性,Jameson-Wolf法预测各结构蛋白的抗原指数,最后获得VP1结构蛋白的B细胞抗原表位.与国内报道序列的二级结构的分析和比较,发现该株病毒VP1基因的抗原表位区域具有一定的差异.
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