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磷酸化修饰是蛋白质上广泛发生，也是被研究最多的翻译后修饰之一。基于高能碰撞诱导解离的串级质谱是磷酸化大规模和高通量定性鉴定和位点定位的最新发展水平的分析平台。目前，数以万计的磷酸化多肽可以在单次的鸟枪法蛋白质组学分析中被鉴定出来[1-11]；然而，磷酸化位点的精确定位仍然存在诸多挑战。假阳性率、假阴性率以及未能定位的谱图比率仍然较高。