【摘 要】
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目的：研究轮状病毒非结构蛋白(NSP4)基因的特征及变异情况。方法：在2007年和2008年昆明医学院第一附属医院儿科住院的96例秋冬季腹泻患儿中，随机选取轮状病毒阳性的12例(其中2007年6例，2008年6例)患儿粪便标本，采用RT-PCR扩增NSP4基因，并进行测序，测序结果用DNAassist软件对核苷酸序列进行翻译，并用Clustal-mp软件与Genbank Datebase中的4株人
【机 构】
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昆明医学院第一附属医院 昆明市延安医院
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目的：研究轮状病毒非结构蛋白(NSP4)基因的特征及变异情况。
方法：在2007年和2008年昆明医学院第一附属医院儿科住院的96例秋冬季腹泻患儿中，随机选取轮状病毒阳性的12例(其中2007年6例，2008年6例)患儿粪便标本，采用RT-PCR扩增NSP4基因，并进行测序，测序结果用DNAassist软件对核苷酸序列进行翻译，并用Clustal-mp软件与Genbank Datebase中的4株人RV(Wa、KUN、AU-1、Hochi)、3株动物Rv(EW、OSU、SAII)和中国北京、上海、广州的流行株的NSP4序列进行分析比较。
结果：(1)选取的2007年6份和2008年6份样本均可以扩增出NSP4的全长片段，测序表明：2007年6份样本中有5株属于Wa株，1株属于KUN株；2008年6份样本中也有5株属于Wa株，1株属于KUN株。10株Wa株与来自GenBank Database的4株人RV(Wa、KUN、Au-1、Hochi)和3株动物RV(EW、OSU、SAII)同源性分别为96.3％、85.3％、84.7％、95.1％和57.7％、92％、82.8％，与中国北京、上海、广州的流行株同源性均在95％以上；2株KUN株与以上来自GenBank Database的标准株的同源性分别为85.3％、98.2％、82.8％、85.9％、60.1％、85.3％、94.3％，和其他地区流行株的同源性为85％左右。(2)以Wa株为参考，10株Wa株的NSP4基因变异发生在第34位氨基酸，第76位氨基酸，第141位氨基酸，第145位氨基酸，第161位氨基酸和第169位氨基酸；以KUN株为参考，2株KUN株的NSP4基因变异仅在第87位氨基酸和第140位氨基酸。
结论：2007年和2008年昆明地区流行株NSP4基因为Wa组和KUN组，以Wa组为主。
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