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测定食蟹猴线粒体全基因组序列对研究食蟹猴分子系统进化具有重要意义。本研究采用PCR扩增并结合克隆测序测定并注释了食蟹猴的线粒体基因组全序列。结果表明：食蟹猴线粒体基因组全长为16575bp (GenBank登录号：NC_012670)，基因组成与脊椎动物线粒体DNA相似，碱基组成为 31.81％A、25.08％T、12.76％G、30.36％C，包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码基因控制区(D-Loop 区)。基于线粒体基因组全序列对食蟹猴与其他12种灵长类动物进行同源性比较，结果显示其与同属(猕猴属Macaca)内的其他近缘种相互间的同源性很高。