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对3株同一地区不同年代H9N2亚型禽流感病毒血凝素(HA)基因进行扩增，PCR产物纯化后送出测序。测序结果表明：所扩增的HA基因全长1683bp，编码560个氨基酸；3个毒株的裂解位点的氨基酸序列为R-S-S-R，属于低致病力毒株；分离株氨基酸推倒序列分析发现均存在7个潜在糖基化位点，受体结合位点为禽源性流感病毒特异性序列，左侧壁氨基酸均为NGQQG，右侧壁均为GTSKA。与一些参考毒株的HA基因序列进行比较分析表明分离株与参考株核苷酸与氨基酸同源率均较高，进化树分析表明3个毒株均属欧亚种系，与A/duck/HongKong/Y280/97代表株亲源关系较近。