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本研究中，我们使用PCR方法，对FDDV感染的FDD细胞中前病毒DNA的env进行了扩增，将PCR产物进行T-A克隆，挑取，阳性克隆用于序列分析。结果表明，，在囊膜蛋白穿膜亚单位TM对应的gp45基因区，病毒基因组env的第2230核苷酸位点出现G→A的突变，gp45基因区提前出现了一个终止密码子TGA，即出现过早停止编码突变(Premature stop codon)，造成gp45基因对应的TM蛋白的截短。Western blot检测FDDV的裂解产物中有截短型TM的存在；用FDDV接种了3匹经琼脂免疫扩散检测确定为EIA阴性的马匹，在免疫后第15d和40d，分别对免疫马匹外周血单个核细胞中EIAV前病毒DNA和血浆中游离病毒粒子的基因组gp45核酸序列进行了分析。研究结果定性地说明gp45基因出现的过早停止编码突变并非致死性突变，其对应表达的胞浆区截短型TM蛋白可参与构成完整的病毒粒子。且这种病毒颗粒可以对马造成感染，并可在体内进行长时间复制。