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目前微生物采油技术已成为提高石油采收率的研究焦点，但仅有大量报道运用纯培养和免培养的方法对油井采出液水相和注入水中微生物群落进行分析。本实验采用基因芯片(GeoChip)杂交技术，对青海油田不同层位的四口油井采出液及其注入水的原油和水相中微生物功能多样性进行研究。多样性分析显示，同油井采出液中原油内微生物功能多样性显著高于水相。聚类分析显示，整体原油样品与整体水相样品聚为两个不同分支，表明原油中微生物的功能结构截然不同于水相。同时，油相中与烃类降解、有机物修复、压力应答及碳循环相关的基因显著多于水相，这一结果与这些基因所表现在油藏中的重要作用相一致。相关性分析指出，原油中的芳香烃、饱和烃和非烃组分对该油藏微生物功能结构的形成有重要影响。进一步对四个原油样品进行比较，发现其微生物功能结构与所处油藏的深度和温度有相关性的递变。本研究也是对原油样品微生物功能结构多样性研究的首次报道。