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深海环境拥有丰富的微生物资源，但目前大量处于不可培养状态.本研究采用不同培养基、温度、抗氧化剂添加情况组合成的6种培养条件对南海底泥的微生物进行分离培养，同时根据16 SrRNA基因并结合ARDRA(限制性酶切片段分析方法)分析研究了不同分离条件下可培养微生物的差异性.结果共获得556株菌株，分别属于变型菌门数量最多达到76.3％，厚壁菌门14.9％，放线菌门7.2％、拟杆菌门3.6％这四个门.不同分离方法均显示该南海底泥样品中主要的微生物类群是赤细菌属，在分离得到的所有菌属中数量最多达到62.59％，其次还包括芽孢杆菌属、嗜盐单胞菌属，施氏假单胞菌属等.