O型口蹄疫病毒猪源分离株VP1基因特征分析

来源 :四川省畜牧兽医学会2010年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:flyskyxun
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  通过对2010年从猪分离鉴定的4株O型口蹄疫病毒VP1基因序列测定,采用DNAStar和Genbank中O型口蹄疫毒株VP1基因进行序列比较分析,结果表明,分离的4株O型口蹄疫病毒相互之间同源率均在97.2%以上,VP1蛋白氨基酸在198位存在特征性的变异(E-A)。运用MAGE4.O软件构建O型口蹄疫病毒进化树,结果显示,分离的4株病毒属于O型口蹄疫东南亚亚型缅甸98谱系。应用DNAstar软件Jameson—wolf方法进行VP1结构蛋白的抗原性指数分析,结果以O/NC/CHa/2010株为代表的CHA亚群抗原指数与东南亚亚型缅甸98谱系相似,而与古典中国、泛亚两种亚型的差别较大。为口蹄疫疫苗毒株的选择提供参考。
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