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应用RT-PCR方法扩增BVDV新疆玛纳斯分离株获得E2基因序列,结果显示:测序获得全长1122bp E2基因,编码374个氨基酸残基;应用软件对序列分析分析,对可能存在的抗原表位预测;通过PCR分别扩增了含主要抗原位点的片段(1-118)-(144-340)-(100-300)-(1-345),并克隆到pMD 18-T Simple载体中;将重组质粒pMD-(1-118)、pMD-(144-340)、pMD-(100-300)、pMD-(1-345)的Hind Ⅲ和Bam H I双酶切产物分别插入pET28a(+),构建原核表达载体pET-(1-118)、pET-(144-340)、pET-(100-300)、pET-(1-345)。将这些原核表达载体分别导入BL21(DE)后用IPTG进行诱导表达,收集的菌液进行SDS-PAGE和Western blot分析。结果表明4个重组质粒在BL21(DE)成功表达,表达融合蛋白的相对分子量分别为18.6ku、28.2ku、29.2ku、43.8ku,与预测蛋白分子量一致,28.2ku、29.2ku、43.8ku的融合蛋白被牛抗BVDV阳性血清识别。初步推测,E2蛋白的100-300氨基酸的区域存在一个未曾报道的抗原表位。