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本研究利用方差分析、聚类分析、判别分析和主成分分析等多元分析方法，对大菱鲆、星斑川鲽及其杂交种的可数性状和可量性状进行了分析。结果表明:(1)可数性状中，杂交种的背鳍鳍条数、臀鳍鳍条数、胸鳍鳍条数、尾鳍鳍条数与父母本都有重叠，不能利用可数性状将三者直观地区分，在腹鳍鳍条数上三者一致。(2)可量性状中，除腹鳍长/体长性状在三者中的差异都不显著外，杂交种有9个性状与大菱鲆差异不显著，但其19个可量性状与星斑川鲽都为显著差异。(3)判别分析表明，利用10个对结果影响贡献率较大的参数分别构建了其判别函数，对大菱鲆、星斑川鲽和杂交种的综合判别准确率达到98.9％，判别效果非常显著。(4)主成分分析表明，共获得了4个主成分，其累积总变异的贡献率为73.49%。其中第一主成分中具有较大方差贡献率的性状遍布全身，这与判别分析得出的结果一致，其可以将星斑川鲽和另外两种区分开，但不能彻底区分大菱鲆和杂交种。大菱鲆和杂交种的形态差异主要表现在第三主成分上，第三主成分上具有较大方差贡献率的性状为腹鳍长和体厚度，说明杂交种在这两个性状上更多继承了星斑川鲽的特征。