【摘 要】
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烟碱样乙酰胆碱受体(nAChR)属于配体门控离子通道家族,广泛存在于肌肉、中枢神经系统和外周神经系统,是药物作用的重要靶点之一.nAChR分为肌肉神经和中枢神经两种类型,都
【机 构】
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北京药物化学研究,北京1044信箱401号,102205
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烟碱样乙酰胆碱受体(nAChR)属于配体门控离子通道家族,广泛存在于肌肉、中枢神经系统和外周神经系统,是药物作用的重要靶点之一.nAChR分为肌肉神经和中枢神经两种类型,都由五个跨膜的同源亚基组成,围绕着阳离子通道排列.本文应用同源模建技术,搭建组成为(α1)2β1εδ的肌肉型nAChR细胞外三维结构模型,采用高分辨率的nAChBP与右旋筒箭毒碱复合物晶体结构(PDB编号：2XYT)作为模板,nAChR氨基酸序列来源于SWISS-PROT数据库.采用多元序列比对方法,使用MODELER程序,进行同源模建.选取MODELER打分最高的模型,进行一系列分子力学和分子动力学优化.分别采用Profile-3D和拉氏图方法验证了模型的可靠性.通过与配体右旋筒箭毒碱的分子对接和动力学模拟研究,初步探讨了nAChR的结构性质及与拮抗剂的作用模式.肌肉型nAChR受体具有两个配体结合部位,分别处于(α1)ε界面和(α1)δ界面之间.结合区域α亚基和非α亚基的芳香性残基侧链和酸性残基侧链,是受体与配体相互作用的关键残基.
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