【摘 要】
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单氨基酸替换的预测工作发展多年来,特征的选取一直试图于精确地描述氨基酸残基的各种理化性质以及进化信息,不管是序列信息还是结构信息,都着力与对单个氨基酸的精确描
【机 构】
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四川大学化学学院,四川省成都市一环南一段望江路29号,610064
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单氨基酸替换的预测工作发展多年来,特征的选取一直试图于精确地描述氨基酸残基的各种理化性质以及进化信息,不管是序列信息还是结构信息,都着力与对单个氨基酸的精确描述。近年来,有工作加入了突变残基对应蛋白的信息以及引起残基突变发生的密码子信息来预测致病单氨基酸替换并且取得了良好的结果。在前期工作中,我们证明了蛋白质网络拓扑特征可以对致病单氨基酸替换预测起到良好的预测效果,在此基础上,我们试图整合多层次的氨基酸信息来进一步提高预测效果,GO信息作为另外一种蛋白水平信息,被证明是单氨基酸替换中的强特征,在本工作中,我们将其与网络拓扑特征结合预测致病单氨基酸替换,考察该特征的优劣以及相关的生物意义。
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