【摘 要】
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从患出血病的草鱼中分离草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV),参照GenBank上登录的草鱼出血病病毒(Grass carp hemorrhagic virus,GCHV)基因序列设计引物,提取病毒
【机 构】
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广东海洋大学,广东湛江524025
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从患出血病的草鱼中分离草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV),参照GenBank上登录的草鱼出血病病毒(Grass carp hemorrhagic virus,GCHV)基因序列设计引物,提取病毒总RNA,应用RT-PCR技术扩增GCRV外衣壳蛋白基因vp5与vp7.vp5基因全长1981bp,完整开放阅读框(ORF)为1947bp,编码648个氨基酸,预测分子量约为71.3kDa.vp7因全长852bp,完整开放阅读框(ORF)为831hp,编码276个氨基酸,预测分子量约为30.4kDa.vp5因氨基酸序列与草鱼出血病病毒(GCHV)、草鱼呼肠孤病毒873毒株(GCRV-873)、金体美洲鳊鱼呼肠孤病毒(GSRV)等vp5因氨基酸同源性较高,同源性达90 ％以上.与美国草鱼呼肠孤病毒(AGCRV) vp4基因氨基酸、新加坡马友鱼呼肠孤病毒(TFV)外衣壳蛋白基因氨基酸同源性相对要低. vp7因氨基酸序列与草鱼出血病病毒(GCHV)、草鱼呼肠孤病毒875、876、991毒株(GCRV-875、GCRV-875、GCRV-991)、草鱼出血病病毒(GCHV)、金体美洲鳊鱼呼肠孤病毒(GSRV)等vp7因氨基酸同源性较高,同源性也高达90％以上,与美国草鱼呼肠孤病毒(AGCRV)、新加坡马友鱼呼肠孤病毒(TFV)、纹斑鲈鱼呼肠孤病毒(SBRV)等vp7因氨基酸同源性相对要低.
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