【摘 要】
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目的:本研究旨在探讨近年来我国北方地区传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitisvlrus,IBV)的分子流行病学规律,进而探讨IBV的遗传变异. 方法:利用生物信息学方法对IBV
【机 构】
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山东农业科学院,济南,250100
【出 处】
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第五届中国兽药大会(中国畜牧兽医学会动物药品学分会2014年学术年会、中国畜牧兽医学会生物制药学分会暨中国微生物学会兽医
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目的:本研究旨在探讨近年来我国北方地区传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitisvlrus,IBV)的分子流行病学规律,进而探讨IBV的遗传变异.
方法:利用生物信息学方法对IBV流行株的囊膜纤突蛋白SI和核蛋白N基因进行比较分析.
结果:2012-13年发生在山东、天津等地的11株IBV毒株高度同源,其S1基因核苷酸(氨基酸)同源性为94.0-100％( 92.8-100％),N基因核苷酸(氨基酸)同源性为98.1-99.1％(98.00-99.8％).进一步的分析发现:IBV流行株与1998年在北方流行的A2株SI基因氨基酸同源性最高,为95.1％-96.7％,年变异频率平均为2.5nt×103/年,而N基因则与LX-04株同源性最高,为96.1％-96.8％,年变异频率平均为5.lnt×l0-3/年.IBV至少在SI基因的3个高变区产生了较多的点突变.变异主要集中在20-65、250-290以及390-395位,GM03在62-65位缺失4个氨基酸.
结论:IBV新流行株可能是A2和LX-04类型毒株的重组,N基因的碱基突变频率高于Sl基因.
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