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创新体系是开放的网络系统，其核心内容是实现科技知识的生产者、传播者、使用者以及政府机构之间的互动，并促进知识与技术的生产与转化应用。同时，开放已日益成为创新体系建设的重要原则。
本研究从知识与技术生产能力、知识与技术的应用转化能力和开放吸纳能力三个方面建立出指标体系，并实证分析中西部地区和东部地区、东北地区的区域创新体系系统功能差异。