法洛四联症VANGL2基因序列变异研究

来源 :中华医学会2012年医学遗传学年会暨全国第十一次医学遗传学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:thedogstar
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  目的 动物实验发现VANGL2与心脏流出道的发育与形成有关.本研究拟观察人类法洛四联症患儿VANGL2基因编码区是否存在变异.方法 将100例法洛四联症患儿(病例组)与200例健康儿童(对照组)纳为研究对象,应用Sanger测序法对VANGL2基因编码区的PCR产物进行测序,使用Mutation Surveyor 3.25 DNA变异分析软件对测序结果与Genbank中的参考序列进行比对,查找是否存在突变以及有差异的单核苷酸多态性(SNP)位点.采用SPSS 17.0软件,对两组不同基因型分布频率进行卡方检验.结果 在编码区共发现4个SNP位点:(1)cDNA1137(rs12086448)位点A>G(K379K),AA、AG和GG基因型在病例组中的频率为35.42%、51.04%和13.54%,在对照组中的频率为43.75%、44.27%和11.98%,两组相比无统计学差异(x2=0.015,p=0.993);等位基因A和G在病例组中的频率为60.94%和39.06%,在对照组中的频率为65.89%和34.11%,相比也无统计学差异(x2=0.005,p=0.942).(2)cDNA1328位点C>T(A443V),CC和CT基因型在病例组中的频率为97.92%和2.08%,在对照组中的频率为97.40%和2.60%,两组相比无统计学差异(x2=0.001,p=0.981),等位基因C和T在病例组中的频率为98.96%和1.04%,在对照组中的频率为98.70%和1.30%,亦无统计学差异(x2=0.000,p=0.986).(3)cDNA1335(rs17380127)位点A>C(G445G)和1401(rs17380141)G>A(P467P),此两位点为连锁位点,同时出现变异,AA&GG、AC&GA和CC&AA基因型在病例组中的频率为96.88%、1.04%和2.08%,在对照组中的频率为96.88%、2.60%和0.52%.经x2检验,1335和1401位点的三种基因型在病例和对照组中的分布无统计学差异(x2=0.016,p=0.992),等位基因A和G在病例组中的频率为97.40%和0.60%,在对照组中的频率为98.18%和1.82%,也无统计学差异(x2=0.006,p=0.938).结论 法洛四联症患儿VANGL2基因编码区中未检测到具有统计学差异突变位点,但在1328位点C>T新发现的氨基酸错义改变是否会影响蛋白功能,值得进一步探索.
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