【摘 要】
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为分析2014-2015年安徽地区猪流行性病毒(PEDV)的变异情况,本研究设计合成3对特异性引物,利用RT-PCR方法对2014-2015年分离的15株PEDV毒株的S基因全序列进行扩增,克隆和
【机 构】
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安徽农业大学动物科技学院 安徽 合肥 230036
【出 处】
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长三角“物联网与现代农业”研究生学术论坛
论文部分内容阅读
为分析2014-2015年安徽地区猪流行性病毒(PEDV)的变异情况,本研究设计合成3对特异性引物,利用RT-PCR方法对2014-2015年分离的15株PEDV毒株的S基因全序列进行扩增,克隆和测序,并对其进行遗传进化分析.结果表明,15株PEDV S基因核苷酸和氨基酸的同源性分别为95.7％-99.8％和95.4％-99.5％；与CV777核苷酸和氨基酸同源性分别为93.7％-95.9％和92.6％-96.8％ 15株安徽毒株除AHBB-1株外,其他14株S基因均存在相同的插入和缺失,与参考毒株CV777相比170-171位核苷酸之间插入AAACCAGGGTGT,413-414位核苷酸之间插入TAA,479-480位核苷酸之间缺失TGGAAA这些位点核苷酸的插入和缺失导致了其编码的氨基酸相应改变.S基因系统进化树分析结果表明,15株安徽毒株除AHBB-1外14株处于同一分支,且与2011-2012年的6株中国其它地区毒株2014-2015年的2株中国其他地区毒株、2005-2009年3株韩国毒株亲缘关系均较密切,而与欧洲株(CV777、Brl)、中国现用疫苗株(CV777-vaccine)及中国早期分离株CH/S亲缘关系均较远.与现用疫苗株(CV777-vaccine)相比,流行毒株S蛋白的主要抗原位点,特别是COE区域发生了变异,提示PEDV在近年呈现快速变异和进化的趋势,因而可能需要选择更有效的疫苗株来控制PEDV的暴发.
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