【摘 要】
：
对41尾感病和22尾抗病兴国红鲤的308个有效克隆进行测序,获得171条不同的MHC Ⅱ类α基因编码序列,分属26个不同的等位基因,其中Cyca-DXA24～Cyca-DXA36为新发现的13个等位基因.MHCⅡ类α基因片段的长度为624bp,包括第1-4个外显子,分别编码信号肽、a1和a2结构域及连接肽/跨膜区.α1结构域的变异明显大于a2结构域,表现在α1结构域中核苷酸和氨基酸变异位点比例(5
论文部分内容阅读
对41尾感病和22尾抗病兴国红鲤的308个有效克隆进行测序,获得171条不同的MHC Ⅱ类α基因编码序列,分属26个不同的等位基因,其中Cyca-DXA24～Cyca-DXA36为新发现的13个等位基因.MHCⅡ类α基因片段的长度为624bp,包括第1-4个外显子,分别编码信号肽、a1和a2结构域及连接肽/跨膜区.α1结构域的变异明显大于a2结构域,表现在α1结构域中核苷酸和氨基酸变异位点比例(55.16％和79.76％)明显高于α2结构域的变异位点比例(45.96％和68.42％).α1结构域的PBR区的非同义碱基替换率(dN)与同义碱基替换率(ds)的比值ω(ω=dN/ds为5.742,远远高于非抗原结合位点(non-PBR)及α2结构域的0.755、0.592,揭示兴国红鲤MHC Ⅱ类α基因的α1结构域在进化过程中受到正向选择作用.等位基因Cyca-DXA24(P ＜0.01)与兴国红鲤对嗜水气单胞菌的抗性相关,等位基因Cyca-DXA3(P＜0.05)、Cyca-DXA4(P＜0.01)、Cyca-DXA6(P＜0.05)、Cyca-DXA33(P＜ 0.05)与兴国红鲤对嗜水气单胞菌的易感性相关.荧光定量PCR结果表明,MHC Ⅱ类α基因在健康兴国红鲤的肾、肝、鳃等10个组织均能普遍表达.人工感染嗜水气单胞菌后,肾、肝、脾3个组织中的MHCⅡ类α基因的表达量均发生了不同程度的变化,表明MHCⅡ类α分子在兴国红鲤的免疫反应中起到重要作用.
其他文献
Background: De novo transcriptome sequencing is a robust method of predicting miRNA target genes, especially samples without reference genomes.Differentially expressed miRNAs have been previously iden
采用线粒体DNA细胞色素b(Cytochrome b,Cyt b)基因片段为遗传标记,分析了南海北部陆架和南沙西南部陆架海域5个黄鳍马面纯Thamnaconus hypargyreus群体的遗传多样性.分析结果表明：在156个样品的779 bp Cyt b同源序列中共检测到56个变异位点和58种单倍型,基于核苷酸Kimura双参数替代模型计算得出的5个群体间遗传距离为0.00295～0.00415
Mauremys mutica (Cantor, 1842) is a wide distributed but now endangered species in China.4 populations of M.mutica were collected to assess the genetic structure using polymorphic microsatellite marke
The northern snakehead (Channa argus) and blotched snakehead (Channa maculata) and their reciprocal hybrids have played important roles in the Chinese freshwater aquaculture industry, with annual prod
为研究细胞周期蛋白E (cyclinE)基因在斑节对虾卵巢发育过程中的作用,对斑节对虾进行高通量测序,获得了PmcyclinE的部分表达序列。通过RACE技术克隆得到一条全长1706bp的cDNA序列。其开放阅读框(ORF)为1263bp,编码420个氨基酸。生物信息学软件分析表明该氨基酸序列含有周期蛋白家族特有的CYCLIN保守区并含有N-糖基化位点及磷酸化位点,经BLAST同源性分析发现,与S
分别以0％(FM1)为负对照(含豆粕55％,鱼粉19％)、0％(FM2)为正对照(含豆粕45％,鱼粉25％)、11％(FPH11)、16％(FPH16)、21％(FPH21)、26％(FPH26)的低分子水解鱼蛋白替代总蛋白制得七组等氮等能饲料,饲喂牙鲆63天,研究高植物蛋白饲料中以低分子水解蛋白替代鱼粉对牙鲆生长性能、非特异性免疫、肝脏IGF-I mRNA表达及脂肪代谢的影响。结果表明,用低分子
采用RACE-PCR技术,对福寿螺(Pomacea canaliculata)进行了热激蛋白70基因(HSP70)的全长cDNA序列克隆(2791bp),其中开放阅读框1932bp,编码了643个氨基酸.BLAST分析显示,福寿螺HSP70基因与其他真核生物有着较高的同源性.采用RT-PCR技术检测雌雄福寿螺在不同温度下,以及同一高温下不同时间点的差异表达.结果显示高温情况下,雌雄福寿螺HSP70
在Toll样受体信号转导过程中,髓样分化因子88 (MyD88)和肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)是参与先天免疫触发下游级联的两个关键适配器的分子.我们分离和鉴定得到了刺参MyD88和TRAF6的cDNA全长(分别记为AjMyD88和AjTRAF6).这两个分子都与哺乳动物和果蝇的直系同源物存在着极高的结构保守性,比如AjMyD88预测氨基酸的典型的死亡结构域(DD)和保守的Toll/IL
采用同源克隆和RACE等技术,首次成功获得金钱鱼(Scatophagus argus) MHC Ⅰ类α基因与β2m微球蛋白基因的cDNA全序列,并扩增和分析其内含子序列.结果表明,α基因序列全长2020 bp,5UTR为86bp,3UTR为866bp,而开放阅读框(ORE)长1068bp,共编码355个氨基酸,推测分子质量约40.09 kDa,包括前导肽、三个结构域(α1、α2、α3)、跨膜区及胞
We first determined the complete mitochondrial genome of the Chinese three-striped box turtle(Cuora trifasciata) ,which has become an endangered species in the world.It is a circular molecule of 16,55