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以杭州湾南岸滩涂养殖为例，对滩涂养殖过程中出现的环境质量恶化、生物病原滋生及食品安全隐忧等问题进行了分析，基于生态学原理提出了滩涂养殖的生态学调控对策。在有效控制外源污染的同时，通过人工湿地生态工程技术调控养殖池塘生态系统结构，恢复自然、健康与稳定的水生生态系统功能，增强对外界干扰的缓冲能力，使水生生态系统处于良性与可持续循环状态，是滩涂池塘生态调控的最佳途径。综合运用生态调控技术是改善滩涂养殖生态环境的必然选择。