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对双孢蘑菇206个栽培菌株的总DNA进行大规模的SRAP、ISSR和RAPD分析,共获得15条SRAP、3条ISSR和2条RAPD标记。利用这20个标记对206个菌株进行聚类分析,获得亲缘关系树状图。结果显示在28%的相似值上,206个菌株可以分为高产型和优质型两大类群,而在100%相似值上,可分为大小72个类群,每群包含菌株数为1~31不等。