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通过对从猪分离鉴定的4株O型口蹄疫病毒VP1基因序列测定，采用DNAstar和Genbank中O型口蹄疫毒株VP1基因进行序列比较分析，结果表明，分离的4株O型口蹄疫病毒相互之间同源率均在97.2％以上，VP1蛋白氨基酸在198位存在特征性的变异(E→A)。运用MAGE4.0软件构建O型口蹄疫病毒进化树，结果显示，分离的4株病毒属于O型口蹄疫东南亚亚型CHA亚群。应用DNAstar软件Jameson-Wlolf方法进行VP1结构蛋白的抗原性指数分析，结果以O/NC/CHA/2010株为代表的CHA亚群抗原指数与东南亚亚型差别较小，而与古典中国、泛亚两种亚型的差别较大，提示今后应对口蹄疫疫苗毒株的选择应有针对性。