烟草脉带花叶病毒基因组序列分析

来源 :广西烟草学会2015年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kxy66
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  为了探明烟草脉带花叶病毒危害和流行的机制,使用RT-PCR技术扩增获得TVBMV云南分离物YN9.1基因组全序列,并进行了基因组结构、序列同源性、氨基酸保守基序、系统进化和重组分析.结果表明,YN9.1基因组具有Potyvirus属病毒典型特征,含有在Potyvirus属病毒中较为少见的NIb/CP切割位点Q/N; YN9.1与其他分离物核苷酸序列同源性为90.5%-91.1%,氨基酸序列同源性为95.2-96.2%.与YND核苷酸和氨基酸序列同源性最高;对HC-Pro和CP保守基序进行了分析.YN9.1具有RITC、PTK、DAG等病毒蚜虫传播保守基序,其中RITC在Potyvirus属病毒中常见形式为KITC;系统进化树分析结果显示,TVBMV进化形成2个组,云南分离物独立进化形成一组,TVBMV进化与地域具有明显的相关性;重组分析发现PY为ZC1和YN的组内重组体,重组位点位于HC-Pro 3'末端和NIb 5'端.
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