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微生物是地球上适应能力最强的生命形式，从冰川到深海底部的热流口，它们拓殖到每一个可到达的小生境中，对极度多样的生存环境的适应造就了它们成为巨大的分子多样性自然资源。自1929年Fleming发现青霉素以来，微生物活性物质的研究开发已成为热点，迄今已发现12000余种微生物产生的天然活性物质和数万种合成、半合成以及采用生物技术等手段制得的衍生物与结构修饰物，微生物来源的抗生素、抗肿瘤药物、免疫调节物质、酶及酶抑制剂、抗虫剂、除草剂等已广泛应用于临床医学和工农业生产及科学研究中。
本文介绍了宏基因组及其研究流程，并简述了宏基因组克隆筛选生物活性物质研究概况，宏基因组文库的构建沿用了分子克隆的基本原理和技术方法，并根据具体环境样品的特点和建库目的采用了一些特殊的步骤和对策。现以土壤环境为例，简要介绍宏基因组文库构建的特点。