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现代生物质谱是一种高灵敏度、高选择性、应用范围广泛的分析工具，不仅能够精确测定未知分子的质量数和元素构成，还能提供关于化学结构的重要信息.对于生物大分子和小分子化合物的研究，质谱都展现出强大的功能.本项目利用高端的液相色谱-高分辨质谱联用系统建立了一整套进行快速筛选与靶蛋白有特异性结合的小分子配体的技术流程，该方法在候选药物分子筛选和酶的调控因子研究方面都有巨大的应用潜力.与其它常用的表征蛋白质-配体相互作用的技术相比，基于质谱分析的新方法具有以下的独特优势：1)无需标记底物和靶蛋白，减少化学标记可能对蛋白的结合性质产生的影响.2)质谱的高灵敏度使靶蛋白的消耗量降至微克级.3)对配体分子和靶蛋白的纯度要求明显降低.质谱能够区分混合底物中的不同组分，对它们各自的结合性质进行表征.4)整套分析流程易实现自动化和高通量.