竹亚科En/Spm类转座子的克隆、鉴定及系统进化分析

来源 :第十一届中国竹业学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:china_jjf_wolf
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  本研究根据竹亚科En/Spm 转座酶保守区域设计一对简并性引物,从毛竹、梨竹、孝顺竹、龟甲竹中扩增出了650bp 左右的目标片段.目的条带经克隆、回收、测序等试验过程及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了206 条 En/Spm 转座子DNA 转座酶序列.这些核氨酸序列的长度变化范围为195~226 bp,同源性变化范围为52.9%~100%.将这些核苷酸序列翻译成氨基酸序列后,将其与不同物种En/Spm 类转座子转座酶的氨基酸序列进行比对及聚类分析并构建进化树,可将其序列分类为Ba_Enspm 1、Ba_Enspm 2、Ba_Enspm 3、Ba_Enspm 4、Ba_Enspm 5 一共5 大类.除此之外,系统进化分析结果显示En/Spm 类转座子虽起源相同,但在竹亚科不同竹种中却产生了分化,具体表现为来源于同一竹种的亲缘关系近且近乎集中分布.
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