【摘 要】
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本文对德国小蠊(Blattella germanica)全基因组中微卫星数量及分布规律进行了分析,找到1-6碱基重复类型的微卫星序列共604,386个,总长度15,301,255 bp,约占全基因组序列(
【机 构】
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四川大学生命科学学院,四川成都,610065
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本文对德国小蠊(Blattella germanica)全基因组中微卫星数量及分布规律进行了分析,找到1-6碱基重复类型的微卫星序列共604,386个,总长度15,301,255 bp,约占全基因组序列(约2.04 Gb)的0.75％,分布频率为1/3.37 kb,微卫星序列的长度主要在12-60个碱基长度范围内.不同类型的微卫星中,三碱基(226,876)重复类型微卫星数量最多,占微卫星总数的37.54％；四碱基(150,355)重复类型次之,占微卫星总数的24.88％；其次依次是单碱基(141,167)、二碱基(60,877)、五碱基(21,570)和六碱基(3,541)重复类型,分别占微卫星总数的23.36％、10.07％、3.57％和0.59％.小蠊的微卫星中,出现最多的重复拷贝类别有：ATT、AAT、A、T、AAAT、ATTT和AT,共411,789个微卫星,占微卫星总数的68.13％,这7种类别的微卫星数量都大于30,000.最后还分析了微卫星在基因组不同区域的分布情况,共有2,321个微卫星在外显子上,它们分别位于1,442个基因上.分别提取这1,442个基因的序列并对其进行GO功能注释和KEGG通路分析.
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