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为探讨体外重建的MHCI复合体BF2-linker-β2m鉴定病毒抗原肽系统能否在体外结合抗原多肽,不同类的MHC I类分子结合同一和不同抗原多肽表位能力的差异,本研究采用人工合成的禽流感病毒的三条多肽,猪口蹄疫病毒的两条多肽,以及来源于草鱼呼肠孤病毒的两条多肽分别与四类体外重建的串联鸡MHC I类分子复合体BF2-linker-β2m进行了体外结合实验。首先BF2-linkcr-β2m与不同的病毒抗原九肽按照1:10的摩尔比进行混合,37℃作用12h后,取反应混合物经蛋白超滤浓缩管4500g离心45分钟以除去未与MHC I类分子结合的抗原多肽;然后将BF2-linker-β2m分别与抗原多肽形成的复合体利用酸洗法将结合的多肽自MHC I类分子的抗原多肽结合槽中洗脱,洗脱后的蛋白和多肽混合物使用3K的超滤浓缩管4500g离心45分钟以收集洗脱的多肽溶液,随后利用C18柱对洗脱的多肽去盐、脱酸处理;将多肽样品冻干,用基质溶解后直接点样上靶进行一级质谱(MS)和二级质谱(MSMS)测定,结果表明,三类体外重建的BF2-linker-β2m可与禽流感病毒多肽KILTIYSTV和LLLAIVSLV发生结合,而不与禽流感多肽TIGECPKYV、及猪口蹄疫病毒和草鱼呼肠孤病毒的四条多肽结合。证实由于MHC I类分子的多态性导致复等位基因的MHC I类分子结合病毒抗原表位的能力存在差异;病毒的T细胞抗原表位是MHC I类分子限制性的;KILTIYSTV和LLLAIVSLV是禽流感病毒的候选表位。