【摘 要】
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为分析芝麻种质资源的遗传变异特点,本研究利用新一代高通量测序技术对来源于12个国家的29份芝麻种质资源进行重测序分析,平均每个样品获得13倍的测序数据,约90％的读段(re
【机 构】
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中国农业科学院油料作物研究所,农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,湖北武汉,430062
【出 处】
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中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会
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为分析芝麻种质资源的遗传变异特点,本研究利用新一代高通量测序技术对来源于12个国家的29份芝麻种质资源进行重测序分析,平均每个样品获得13倍的测序数据,约90％的读段(read)能比对到参考基因组上.群体中共检测到2 348 008个SNP,平均8.6/kb个SNP；分析发现该群体的连锁不平衡衰减距离约为150kb；聚类分析和群体结构分析未能清晰分开地理来源不同的材料；群体的多样性参数(π)和Watterson参数(θw)分别为2.5 ×10-3和3.0×10-3,两个参数在染色体上的分布存在高变区域和低变区域,其中高变区域的基因主要与环境适应性有关,如参与对胁迫应激反应的基因.此外,与脂肪转运有关的基因也较多地表现出丰富的变异,而油酸和亚油酸去饱和酶等基因相对较为保守.研究还对群体的indel和SV变异进行了分析,为深入开展种质资源的相关研究提供了基础.
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