【摘 要】
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KDM5B是一种组蛋白H3K4me3去甲基化酶,文献报导[36],参与转录抑制乳腺癌细胞的发育,因此研究KDM5B的去甲基化机制对理解乳腺癌发生与发展病理机制很有帮助.最近研究指出
【机 构】
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中科院上海有机化学研究所,生命有机化学国家重点实验室,上海200032复旦大学生物医学研究院,上海200032
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KDM5B是一种组蛋白H3K4me3去甲基化酶,文献报导[36],参与转录抑制乳腺癌细胞的发育,因此研究KDM5B的去甲基化机制对理解乳腺癌发生与发展病理机制很有帮助.最近研究指出敲除掉KDM5B蛋白N-端的PHD1结构域后,KDM5B即完全失去去甲基化功能,这表明该PHD1结构域对KDM5B的去甲基化过程非常关键.但有关KDM5B的PHD1结构域如何影响它们的组蛋白去甲基化过程尚未有文献报导.体外结合实验表明,KDM5B-PHD1 特异性结合未甲基化修饰的H3K4.通过体内与体外实验,发现KDM5B 的PHD1 结构域主要是通过结合组蛋白去甲基化的产物H3K4me0 来发挥其去甲基化功能（submitted, 2014）.我们采用NMR 技术分别确定了自由态PHD1 及PHD1 与H3K4me0 肽链复合物的三维结构,并比较它们结构的差异性.从结构对比中发现了一些对识别组蛋白肽链起关键作用的氨基酸残基,随后对它们进行突变以破坏PHD1 与H3K4me0 之间的相互作用.突变后,KDM5B 在细胞内的去甲基化活性减弱,且对乳腺癌细胞的发育调控也减弱.该结构还表明,残基H3K9 没有参与KDM5B 的PHD1 结构域与H3K4me0 肽链的相互作用.具体结果如图所示.
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