芸薹属物种中不同转座子元件的转录激活及其插入基因序列的偏好性鉴定分析

来源 :中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zskarl
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  转座元件通过转座可实现基因组序列的迅速扩增或者消除,从而引起基因组重塑和基因变异.然而,从基因组水平上来鉴定不同转座子的转录激活和在不同基因组中的插入偏好性分析较少.本研究中,我们对芸薹属物种中可自主转座的转座子基因以及插入有转座子的表达序列进行分析,来鉴定转座子的转录激活及其转座子偏爱性插入的基因的特征.结果表明,不同类型的转座子的转录激活活性不同,长末端重复反转座子(LTR-retrotransposon)为转录活性最高的转座子.所检测的序列中的6.1%插入有LTR-retrotransposons基因.某些转座子倾向于插入到细胞元件特异性基因中,并作为结合因子参与代谢过程.某些转座子偏爱性插入到与重要的分子功能相关的宿主基因中,并表现为时空表达特性.这些结果表明不同类型的转座子对基因变异和基因功能具有不同的影响.
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