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现在的海南植物区系以热带分布的科和属占优势，在属的地理成分构成上热带亚洲成分比例最高，显示了它是一个热带性质的植物区系，并有热带亚洲亲缘。通过与周边的中国广西和广东以及越南植物区系的比较，海南植物区系与越南植物区系的类似性最大，其次是广西植物区系；在所比较的这些植物区系中，有110 个属仅海南与越南共同具有，有7 个属仅海南与广东共同具有。