【摘 要】
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采用MiSeq 16S rRNA高通量测序技术和生物信息学分析方法,构建了牙鲆工厂化人工育苗模式下仔稚幼鱼阶段6个不同时期的18个样品的16S rRNA基因测序文库,共获得7462个OTU,分类为42个菌门,972个菌属。对肠道菌群的形成过程及结构多样性变化分析表明,初孵仔鱼的菌群组成多样性丰富,体内的优势菌为变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门;在9日龄和21日龄摄食轮虫和卤虫幼体样品中,肠道的优势菌群
【出 处】
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中国水产科学研究院黄海水产研究所第十二届研究生学术交流会
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采用MiSeq 16S rRNA高通量测序技术和生物信息学分析方法,构建了牙鲆工厂化人工育苗模式下仔稚幼鱼阶段6个不同时期的18个样品的16S rRNA基因测序文库,共获得7462个OTU,分类为42个菌门,972个菌属。对肠道菌群的形成过程及结构多样性变化分析表明,初孵仔鱼的菌群组成多样性丰富,体内的优势菌为变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门;在9日龄和21日龄摄食轮虫和卤虫幼体样品中,肠道的优势菌群结构较单一,变形菌门成为此时期肠道的优势菌群;45日龄摄食配合饲料后,变形菌门的相对丰度显著降低,厚壁菌门和拟杆菌门的相对丰度明显增大,成为肠道菌群的优势菌群。由属水平的菌群结构发现,仔稚幼鱼肠道优势菌群的种类和数量都发生了较大变化,在9日龄和21日龄时期弧菌属相对丰度最高,到45日龄时期后相对丰度锐减到最低水平;拟杆菌属和普氏菌属在80日龄后达到较高水平,成为肠道优势菌属;厚壁菌门的8个菌属在80-115日龄时期均发展成为优势菌属,定植于肠道。研究结果揭示了工厂化人工育苗模式下牙鲆仔稚幼鱼肠道菌群结构及演替规律。
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