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所有性别的大肠微生物均能发酵色氨酸产生猪肉主要的膻味物质粪臭素,但有报道发现公猪脂肪中沉积的粪臭素水平较高,并认为肝脏粪臭素代谢能力的性别差异是其可能的原因。猪大肠菌群结构及其发酵色氨酸产粪臭素的能力是否也存在性别差异目前尚不明确。因此,本研究利用基于16sRNA的高通量测序技术分析不同性别猪粪样菌群结构,同时,利用高效液相色谱技术(HPLC)测定粪样中粪臭素、吲哚水平,然后通过菌群结构与膻味物质的相关性分析确定膻味物质产生相关的菌属。(方法)分别采集20、85和185日龄母猪、去势公猪及公猪粪样用于粪臭素和吲哚水平的测定及菌群结构的分析。(结果)测序结果显示:所有粪样样品中共得到13个菌门、229个菌属和14801个OTUs。在门水平,Firmicutes和Bacteroidetes作为优势菌门,它们分别占到总菌群丰度的6.3%和89.7%;185日龄时,公猪粪样Actinobacteria的相对丰度显著高于去势公猪(P<0.05);公猪和去势公猪粪样中Firmicutes的相对丰度显著低于母猪(P<0.05);而母猪粪样中Proteobacteria的相对丰度显著高于去势公猪(P<0.05)。在属水平,20日龄时,不同性别猪粪样菌群没有显著差异;85日龄时,不同性别之间共检测到10个存在显著差异的菌属,包括:Lactobacillus、Streptococcus、Lachnospiracea incertae sedis、Clostridium sensu stricto、ClostridiumⅪ和Butyricicoccus等;185日龄时,不同性别间共检测到11个差异显著的菌属,包括:Clostridium sensu stricto、ClostridiumⅣ、Ruminococcus、Flavonifractor、Bifidobacterium、Barnesiella和Lactobacillus等。在OTUs水平,20日龄时,母猪粪样中OTU23645(G:Lactobacillus)的相对丰度及公猪粪样中OTU23649(G:Barnesiella)的相对丰度要高于其他两组(P<0.05);85和185日龄时,同时检测到OTU24517(G:Oscillibacter)在不同性别猪的粪样中存在显著差异。HPLC结果显示:20日龄时,公猪粪样中粪臭素的水平显著高于母猪和去势公猪;而85日龄和185日龄时不同性别猪粪样中粪臭素的水平无显著差异。相关性分析结果显示:粪样中粪臭素的水平与Bacteroidetes和Firmicutes中的一些菌属存在显著相关,例如:Clostridium和Oscillibacter等。综上所述,本研究首次利用高通量测序技术发现猪粪样中的菌群组成存在一定的性别差异,这种差异与粪样中粪臭素水平存在一定的相关性。该研究结果为通过调控肠道内菌群结构来控制粪臭素等膻味物质的产生提供了一定的依据。