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首次利用SRAP技术对海南省9种石斛种质资源的遗传多样性及亲缘关系进行了分析。从30对SRAP引物中筛选获得18对多态性引物，对石斛属的9个种的基因组DNA进行扩增。共获得285条多态性带，平均每个引物产生15.8个多态性条带。材料间遗传相似系数变化范围为0.179～0.636，说明本实验所测试的材料具有较广的遗传变异。根据SRAP标记的结果，采用UPGMA法进行聚类分析，将石斛属的9个种区分开来，划分为4类。结果表明：海南省内分布的石斛具有丰富的遗传多样性；SRAP标记技术很好地从分子水平上揭示石斛种质资源的遗传背景、亲缘关系。