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【摘 要】
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目的 探究肺炎链球菌R6中未知蛋白Spr0934与其潜在配体铁色素相互作用的机制.方法 基于Uniprot数据库对目标蛋白Spr0934进行同源序列比对,筛选出与其同源性较高的候选蛋白;利用Spr0934蛋白结构与铁色素配体进行分子对接;分子动力学模拟技术检测铁色素被靶标蛋白结合之后引起的结构变化,并分析二者的结合机理.结果 Spr0934与多个细菌蛋白具有较高同源性,其中铁色素结合蛋白4HMQ的活性中心与该蛋白相似性最高;分子对接的结果显示,铁色素与Spr0934的结合能量稳定在-6.27 kcal/m
【机 构】
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广东医科大学科研平台服务管理中心,广东东莞523808;广东医科大学衰老研究所,生物化学与分子生物学研究所,广东省医学分子诊断重点实验室,广东东莞523808
【出 处】
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广东医科大学学报
【发表日期】
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2022年1期
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