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采用72对MSAP选择性扩增引物分别对16个经双酶切后的非洲堇DNA样品进行全基因组甲基化分析，其中49对引物组合扩增出的条带清晰、丰富且重复性好，通过对所扩增出的带形进行分析发现，有近1／4的DNA其甲基化状态存在差异，其中包括同一个体中茎段和叶片之间以及同基因型不同个体之间在CCGG位点上的甲基化差异，结果表明，同一个体中叶片的甲基化水平高于茎段；同基因型不同个体中通过茎段扦插方式繁殖的后代，保持了母本组织中DNA的甲基化状态，而通过叶片扦插繁殖的后代DNA甲基化状态发生了重建，且后代叶片组织中的甲基