毛竹中黄酮-C-糖基转移酶基因的克隆和生物信息学分析

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糖基转移酶是催化黄酮糖苷形成的关键酶.黄酮糖苷类化合物具有抗氧化、清除自由基、调节血脂和血糖等生理作用.基于毛竹基因库测序的完成,本研究通过RT-PCR技术首次获得一条完整的毛竹黄酮-C-糖基转移酶基因开放阅读框,将其命名为PeCGT,其基因的序列长度是1342bp.对其编码蛋白的理化性质、保守结构域以及二级结构和空间结构等进行了生物信息学分析.结果 表明:PeCGT基因编码的蛋白含有447个氨基酸,分子量是47.76kD,理论等电点为4.91,酸性氨基酸(Asp+Glu)个数为54,碱性氨基酸(Arg+Lys)个数为35.PeCGT蛋白是疏水型蛋白,不存在信号肽,存在于线粒体中.结构域预测分析结果表明,PeCGT编码的氨基酸序列具有明显的糖基转移酶特征的保守域结构PSPG.通过同源性分析,其与乌拉图小麦(Triticum urartu)、节节麦(Aegilops tauschii subsp.Tauschii)和二穗短柄草(Brachypodium distachyonhiihii)具有较高的同源性.实时荧光定量PCR结果表明:PeCGT基因在叶中的表达量最高,在根中几乎不表达,在茎中有部分表达.此研究结果为以后毛竹黄酮-C-糖基转移酶的表达和功能鉴定提供了一定的帮助.
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