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通过引入数据包络分析(DEA)对1994-2010年我国经济运行效率进行测算,发现我国经济效率总体上有所提高。选取R&D人员数和R&D经费支出作为科技投入指标,运用协整理论和误差修正模型对R&D人员投入、R&D经费支出、经济效率这三者的短期、长期关系进行了实证检验。模型结果显示,科技投入对提高经济效率的长期影响大于短期影响。R&D人员投入增加提高了经济运行效率,R&D经费支出增加降低了经济效率。