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采用生物信息学分析方法对 GenBank 中来源于茶树、可可、山茶等植物咖啡碱合成酶的氨基酸序列进行比对分析，就等电点、亚细胞定位、信号肽、跨膜螺旋、保守性功能结构域及基序、二级结构与三级结构等重要参数进行预测与分析。结果表明，植物咖啡碱合成酶主要定位于胞质和胞核中，含有磷酸化、酰基化和糖基化修饰位点，基于基因序列与保守结构域可被分成3种类型，其中 I 型与 II 型酶蛋白均属全α型水溶性酶蛋白，III 型酶蛋白除二级结构富含无规卷曲构件，还极有可能存在信号肽序列，但3类酶蛋白均无跨膜螺旋，三级结构预测显