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嘌呤代谢是动物含氮废物排出体外的重要途径之一。嘌呤代谢终产物在不同动物各不相同。这是由于进化过程中，参与代谢1种或多种酶基因或者酶活性的丢失所致。本文从JGI网站佛罗里达文昌鱼基因组数据库中搜索文昌鱼参与嘌呤代谢主要5种酶（黄嘌呤脱氢酶、尿酸酶、尿囊素酶、尿囊酸酶、尿素酶）的基因，并且将它们与其他12种具有代表性且基因组序列已知的动物包括人、小鼠、狗、鸡、爪蟾、河豚、斑马鱼、海鞘、海胆、果蝇、线虫、海葵的基因结构进行比较。结果发现文昌鱼参与嘌呤代谢的酶基因有的和脊椎动物基因相似（黄嘌呤脱氢酶和尿酸酶），有