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灵芝由菌丝体和子实体组成。其菌丝无色透明，具分隔及分枝，表面常分泌白色草酸钙结晶。子实体由菌丝形成，分菌柄、菌盖和菌伞下边的子实体三部分，成熟后的子实体木质化，其皮壳组织革质化，有赤褐色光泽。菌盖多为肾形，上有环状轮纹及辐射状皱纹，大小不一，一般5～12厘米×10～20厘米，厚达2厘米，下边有无数小孔，管孔呈白色或淡褐色，平均每平方毫米4～5个；内壁为子实层，孢子从子实层内产生。孢子褐色，卵形，8～11微米×5～7微米，中央含一个大油滴。菌柄侧生，长5～19厘米，色与菌盖相同。