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染色体图象处理系统具有７组６７个功能，基本功能有视频处理、图象预处理、染色体配对和排序、图形功能、标注和批处理功能。把该系统应用于苯中毒工人遗传学生物标记研究、兰索拉唑对中国仓鼠肺细胞染色体畸变的影响研究、妇产科病人标本及猴外周血淋巴细胞标本的观察和分析的结果表明，该系统实用性强，并具有先进性、稳定性、灵活性和可拓展性等特点。