人核受体nr5a2(hb1f)基因组序列的生物信息学分析

• 作 者: 张成康 林伟 蔡彦宁 董辉 李嵋 付刚 谢幼华 黄谷杨 汪垣
• 机 构: 中国科学院上海生命科学研究院,中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所,上海,200031国家人类基因组南方研究中心,上海,201203
• 出 处: 科学通报
• 发表日期: 2002年1期
• 关键词: 核受体 nr5a2(hb1f) 基因结构 生物信息学 比较基因组学 启动子

在克隆了人核受体基因nr5a2(hb1f )的cDNA的基础上, 测定了该基因的全基因组序列. 采用生物信息学手段对nr5a2(hb1f )基因组序列进行了深入分析. 序列同源性比较及编码序列预测结果提示, 在测定的210 kb基因组序列中,特别是人nr5a2(hb1f )基因的内含子中可能还存在其他的编码信息. 通过比较基因组方法分析不同生物nr5a基因的结构, 发现各种生物nr5a基因的结构具有保守性, 并且在进化过程中有明显的基因重复现象. 对斑马鱼、小鼠和人nr5a2基因上游序列的比较, 显示这些生物nr5a2基因的启动子区域相当保守, 提示不同生物的nr5a2基因可能受到同一类转录因子的调控.