基于新三维图形表示及相似度量的DNA序列比较分析

• 作 者: 田智鲲 肖前军 周立前
• 机 构: 湖南工程学院理学院,湖南理工职业技术学院基础课部,湘潭大学数学与计算机科学院
• 出 处: 湘潭大学自然科学学报
• 发表日期: 2010年3期
• 关键词: 图形表示 DNA序列 几何中心 波动幅度 相似度量 相似分析 graphical representation DNA sequence geometrical
• 基金项目: 湖南省教育厅项目（10C0185）

基于DNA序列的混沌游戏表示,得到了一种新的能够避免信息损失的DNA序列的3维图形表示.同时,利用特征曲线的几何中心和波动幅度构造4维向量来刻画DNA序列.基于两种新的相似度量,对11种物种的β球蛋白基因序列进行相似性分析,所得结果与生物学中的进化关系基本一致.而且通过比较分析,提出的方法对较长生物序列的相似分析更有效.