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目的探究HIV感染合并慢性腹泻患者粪便标本的病原微生物,以便为患者的治疗提供依据。方法选取2014年3月12日-2016年10月12日我院接收的HIV感染合并慢性腹泻的58例患者粪便作为研究标本,采用涂片及染色检查等手段做病原微生物的检测分析。结果粪便标本中病原菌检出阳性率为60.3%,其中真菌阳性率为27.6%,隐孢子虫阳性率为15.5%。结论真菌是HIV感染合并慢性腹泻患者粪便中检出率最高的病原微生物,隐孢子虫的检出率也较高,其他检出的病原菌包括分枝杆菌、空肠弯曲菌、难辨梭状芽孢杆菌、沙门菌等。积极地