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重庆市中药博物馆始建于1957年，直辖后，在市委市政府的支持下，新馆于2002年底建成投入使用。博物馆馆藏有中药动植物标本共计约33万份，其中药用植物标本30多万份、药材标本2．5万多份、动物标本7000多份和少量的矿物标本。各类标本主要采集于我国中药资源最为丰富、生物多样性及物种最具特色的西南地区、青藏高原及西北地区，涉及物种6500余种。