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罗非鱼作为联合国粮农组织（FAO）向全世界推广的水产养殖对象，在我国的养殖产量已跃居世界首位。但目前罗非鱼养殖普遍存在种质退化和混杂问题，使其苗种在生长速度、雄性率等养殖要素参差不齐，影响其产业化发展。通过合理引种和开发培育新的杂交品系是培育优质罗非鱼品种的有效途径之一（李思发和蔡完其，1999）。AFLP技术在水产研究上已有应用（王志勇等，2001；Kocher etal．，1998）。