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科技企业孵化器的运行受许多因素的影响，为了进一步发展和壮大科技企业孵化器，有必要对影响其运行的相关因素进行分析。结合相关理论和国内外科技企业孵化器运行的成功经验以及我国科技企业孵化器运行的实际情况，我们认为影响我国科技企业孵化器有效运行的主要因素可以分为外部因素与内部因素两大类：外部因素包括国家国家政策、社会相关支持网络等；内部因素包括自身组织模式、发展战略模式、运营模式、专业化等。